Oskar Rantala Törnfeldt gjorde två mål, övriga mål för hemmalaget gjordes av Granit Ademi och Kristoffer Thydell.
Halmia har tre segrar, en oavgjord och en förlust på de senaste fem matcherna, medan Ytterby har tre vinster och två förluster.
För Halmia gör resultatet att laget nu ligger på fjärde plats i tabellen, medan Ytterby är på åttonde plats.
I nästa omgång har Ytterby Kongahälla hemma på Ytterns IP, fredag 3 juni 19.00.