Nathalie Hansen gjorde matchens enda mål i första halvleken.
Segern var Kongahälla/Kungälvs fjärde på de senaste fem matcherna.
Det här var Kongahälla/Kungälvs andra uddamålsseger.
Resultatet betyder att båda lagen har oförändrad position i tabellen, Warta på sjätte plats och Kongahälla/Kungälv i serieledning.
Torsdag 16 maj 20.15 spelar Kongahälla/Kungälv hemma mot Zenith B.